改變了企業組織結構。
在傳統的企業組織結構中，中層管理人員起著給信息、給信息的作用，而在已經實施電子商務的企業中，網絡承擔了這壹作用，為企業組織結構的多元化發展創造了條件。電子商務減少了承上啟下的中間層，縮短了互動和影響的時滯，迅速提高了信息傳遞的效率，顯著增強了市場競爭力。
改變了企業的運營方式。
電子商務是壹種新的貿易形式，它用數字網絡和設備取代了傳統的紙質媒介。這種形式突破了傳統企業單向物流的運作模式，實現了以物流為基礎，信息流為核心，商流為主體的全新運作模式。在這種新的經營模式下，企業信息化水平將直接影響企業供銷鏈的有效建立，進而影響企業的競爭力。
改變了企業的營銷管理。
過去批發零售的方式將被電子商務取代，人們將直接從網上購買，傳統的人員銷售將失去大部分市場，廣告也將改變以適應新媒體。管理層對目標市場的選擇和定位將更多地取決於互聯網用戶的信息和對網絡的充分利用。目前，越來越多的企業開始使用網絡和傳統營銷相結合的方式進行管理，取得了顯著的效果，顯著降低了營銷費用，使營銷預算更加方便和準確。
影響企業的結算方式。
企業可以通過網上銀行系統實現電子支付、資金結算、轉賬和授信。雖然目前信用傳輸的主要安全和認證問題還沒有完全解決，但是紙幣流被無紙化的電子流取代是不可阻擋的發展趨勢。
改變企業競爭方式。
電子商務改變了上下遊企業之間的成本結構，增加了上下遊企業改變供銷合同的機會成本，從而進壹步加強了上下遊企業之間的戰略聯盟。電子商務不僅為消費者和企業提供了更多的選擇消費和開拓銷售市場的機會，而且改善了信息交流的更緊密場所，從而提高了企業把握市場和消費者了解市場的能力。