莖皮含有紫杉醇。
心材中含有紫杉醇、全同立構樹脂醇和異落葉松樹脂醇。
種子含有紫杉堿和紫杉堿，即12β，16β-環氧-1165438-羥基-12。12-二氧紫杉烷(12β，16β-環氧-11β-羥基-12，12-二氫紫杉烷)E，紫杉烷，紫杉烷b。
假種皮含有紫杉烷、10-二十九烷醇(10-二十九烷醇)、果糖、葡萄糖、山梨醇、蔗糖、曲酸等。曲酸可能是假種皮幹燥過程中產生的代謝產物。
此外，東北紅豆杉還含有紫杉酮，即22-脫氧蛻皮甾酮。