1，計算方法不同:396利潤指企業實際支付的融資利率，計算公式為實際融資成本=利息費用除以實際融資額；369利潤是指企業在不同融資方式下的加權平均融資成本，計算公式等於加權平均融資成本(短期貸款利率乘以短期貸款比例加長期貸款利率乘以長期貸款比例加股票發行成本乘以股票比例)除以(短期貸款比例加長期貸款比例加股票比例)。
2.不同含義:396利潤是指企業實際支付的融資成本，反映企業融資的實際情況；三六九利潤是指不同融資方式下企業融資成本的加權平均值，反映了企業融資的整體情況，包括不同融資方式的影響。