1.原料不同:散裂中子源是指發射的中子是在源材料(如鈾-235、鈈-239)的核裂變過程中產生的，具有相對較高的能量(幾百萬電子伏)，各向同性；硼中子是指將硼酸、硼氫化鈉等含硼化合物置於中子源發生器中，中子通過核反應與硼結合形成低能中子，從而產生新的中子源。
2.使用方向:散裂中子源可用於核研究、同位素生產、等離子體物理、核醫學等領域。硼中子源適用於放射性同位素中子探測器、反應堆探測器、中子圖像探測器等應用。