基差不完全等於持倉成本，但基差的變化受制於持倉成本。歸根結底，持倉成本反映了期貨價格與現貨價格基本關系的本質特征，基差是期貨價格與現貨價格實際運行變化的動態指標。雖然期貨價格和現貨價格基本同向，但變動幅度往往不同。所以，基礎不是壹成不變的。隨著現貨價格和期貨價格的不斷變化，基差有時擴大，有時縮小。最後，由於現貨價格和期貨價格的趨同，基差在期貨合約交割月趨於零。
如果期貨開倉或平倉時基差發生變化，銀行可能會在期貨交易中出現虧損，減少交易者在現貨市場的收益。但壹般來說，基差風險會小於現貨市場的利率風險，這也是商業銀行和客戶利用金融期貨交易規避利率風險的原因。