證券的概念很寬泛，如果單就資本市場而言，發行證券可以指發行普通債券，可轉換公司債券，可交換公司債券，以及新股~
所以說“上市公司申請公開發行證券或者非公開發行新股”，前者指債券或者股票，而後者特指股票，而且是非公開發行的。
公開發行的股票類似於IPO，需要申購，是搖號決定是否中簽。而非公開發行也就是定向增發是有發行對象人數限制的，有12個月的鎖定期，都需要保薦人的保薦。
舉個例子，上半年中行發行的可轉換債券就是“上市公司申請公開發行證券”，商業銀行們為了補充資本金而發行的債券也是“上市公司申請公開發行證券”，特變電工剛剛進行完的公開增發也是“上市公司申請公開發行證券”。這些都屬於“上市公司申請公開發行證券”，都需要保薦人的保薦。
但是比如去年金地集團的定向增發就是“非公開發行新股”。這批增發股昨天，也就是2010-08-17解禁，這種非公開發行新股也需要保薦的。
至於您說的那個“種類股”，據我所知，證券市場好像還沒有這個概念~~~
希望我的回答對您有幫助~