跟蹤誤差最能衡量基金公司和基金經理的指數基金管理能力。壹般來說，跟蹤誤差越小，指數基金的操作越準確、規範。即使標的指數相同，不同基金管理公司的指數基金跟蹤誤差也有較大差異。
指數基金出現錯誤的原因；
1.管理費是指數基金運作的基本成本，也是基金經理勞動應得的報酬。管理費壹般占基金凈值的壹定比例，管理費壹般按日計算，按月計提。更重要的是，管理費作為壹種不可避免的成本因素，是壹種單向成本，這種成本導致的跟蹤偏差為負。
這種負偏差的存在只能降低復制組合的總收益，這是指數基金在更多時間內跟蹤偏差為負的根本原因。
2.基準指數中成份股的數量和成份股的流動性因素會導致跟蹤偏差。如果成份股數量少，完全可以按照基準指數中的權重復制。如果成份股數量較多，在不影響成份股當前市場價格的情況下，會出現部分成份股因流動性不足而難以買入的情況。
所以對於這種基準指數，只能用抽樣復制的方法，增加活躍股票的權重，降低非流動性股票的權重。顯然，這種復制會時不時地偏離其基準指數，必然導致跟蹤誤差。