(1)股票回購需要大量資金支付回購成本，容易造成資金短缺，降低資產流動性，影響公司後續發展。
(2)股票回購無異於股東退股，減少公司資本，也可能使公司的創始人股東更加關註企業家利潤的實現，從而不僅在壹定程度上削弱了對債權人利益的保護，也忽視了公司的長遠發展，損害了公司的根本利益。
(3)股票回購容易導致公司操縱股價。回購自己的股份容易導致利用內幕信息進行投機，加劇公司行為的不規範，損害投資者利益。