1.交通配置不同:東入口以公交為主，通常公交較多，如公交、地鐵等，方便乘客乘坐公交前往火車站，西入口以私人交通為主，主要是私家車等私人交通，方便乘客乘坐私人交通前往火車站。
2.客流不同:東入口客流量大，杭州東站是大型交通樞紐，連接多個城市的鐵路線，而西入口客流量小，杭州西站相對較小，主要承擔部分城際鐵路的運輸任務。