股票質押融資實質是質押貸款，其資金用途雖然可能會有限制，但監控難度顯然大得多，當股票市值下跌時，借款債權的風險就隨之增加。
股票質押融資壹般由銀行、典當行等機構辦理，資金融出主體與融資融券有明顯區別。融資融券在各國采取了不同的運作模式。例如，在美國市場化分散授信模式和日本專業化模式下，融出資金的中介有證券公司和證券金融公司，但最終的資金融出方通常是銀行。我國采取的運作模式則規定資金融出的直接主體是證券公司，即證券公司以自有資金、證券向客戶融資融券；同時，確立了證券金融公司向證券公司提供轉融通的制度。