以機構持股來看，日本軟銀集團是阿裏巴巴最大的股東，持股比例達34.4%。雅虎第二，持股比例為22.5%。二者合計57%。
以個人持股來看，阿裏巴巴董事局主席馬雲持股比例僅為8.9%。阿裏巴巴聯合創始人蔡崇信持股比例為3.6%，而阿裏巴巴CEO陸兆禧、COO張勇等高管的持股比例均未超過1%。