發行股票的手續費從股票溢價中扣除，溢價不足扣除的部分沖減資本公積。費用中不包括手續費和傭金。
與企業合並直接相關的費用包括:為企業合並而發生的會計、審計、法律服務和咨詢費用。應計入合並成本。
例如，參與合並的各方可以在企業合並合同或協議中約定，如果被購買方的凈利潤連續兩年超過壹定水平，則購買方需要支付額外的對價，應當計入合並成本。