到目前為止，醫學上對巴赫的最終死因還沒有明確的、令人信服的依據。然而，各種記錄表明，巴赫患有眼疾，他的視力直接影響了他的日常作曲和托馬斯·丘奇的指揮工作。有分析認為，有跡象表明，巴赫進入中年後壹直患有白內障。
晚年癥狀明顯加深，在1749年去世前壹年差點失明。
值得壹提的是，在巴赫家族的同齡人中，還有曾經是眼疾患者的堂兄弟約翰·戈特弗裏德·瓦爾特(1784-1848)和約翰·恩斯特·巴赫(1683-1739)。
擴展數據:
巴赫的家族在過去的300年裏出現了52位音樂家，是音樂史上少有的“音樂世家”。他是歐洲巴洛克時期的代表人物。它以豐富的音樂創作被譽為歐洲古典音樂的鼻祖，以其深遠的歷史影響被許多人尊稱為“音樂之父”。
1750年7月18日，巴赫在靈光壹現後又掙紮了十天。7月28日，他終於離開了人世，壹代宗師去世。巴赫死後，遺產分給了孩子們，但沒人關心他的遺孀安娜·馬格琳娜。她很窮，不得不住在救濟院。十年後，她悄然離世。