銀聯清算以接入商戶為目標，通過相應的商業銀行，依托CNAPS進行清算。舉個例子，妳拿著壹張工行的卡，在建行的pos機上刷卡，可以看到妳的賬戶被實時扣款了，但是工行、建行、銀聯的交易實際上並沒有結算。銀聯作為CNAPS的特權參與者，會通過CNAPS發消息扣工行的錢，加建行的錢。
因此，銀聯和CNAPS是兩級系統。
應該將CIPS與CNAPS相比較。目前，跨境人民幣清算通過CNAPS進行，主要代理人為中國銀行。簡單來說，銀聯通過中國銀行代理進行跨境交易清算，依托CNAPS。CIPS推出後，跨境交易不僅可以走CNAPS，還可以選擇CIPS，不壹定要通過中國銀行的代理。CIPS的所有直接參與者都可以代理清算海外銀行。