1、戰略定位不同：國家自貿區旨在推動形成全面開放新格局，探索開放型經濟新體制，促進外向型經濟發展；而滬津閩粵自貿區則是為了深化改革創新、擴大開放合作，以提升資源配置效率、提高國際競爭力。
、政策優勢不同：國家自貿區的優惠政策主要是稅收減免和關稅優惠等，而滬津閩粵自貿區則在此基礎上增加了金融創新、投資便利化等政策支持。
3、產業布局不同：國家自貿區的產業布局主要集中在制造業和服務業等領域，而滬津閩粵自貿區則更加註重高新技術產業和創新服務業的發展。
4、發展模式不同：國家自貿區的發展模式主要以政府主導為主，而滬津閩粵自貿區則強調市場主體在發展中的重要作用，更加註重發揮市場機制的作用。
5、區域範圍不同：國家自貿區的區域範圍相對較廣，涉及多個省市，而滬津閩粵自貿區則主要集中在沿海地區或港口城市。