第壹、它們所體現的關系不同
股票所體現的是股權關系，債券所體現的是債權關系，而基金券所體現的則是信托關系。
第二、資金投向不同
由於股票和債券是融資工具，其融資投向主要在於實業，而基金由於是信托工具，其投向則在於股票或債券等有價證券。
第三、收益與風險不同
股票的收益取決於公司的經營效益，投資股市風險較大；債券的收益是既定的，其投資風險較小；基金券主要投資於有價證券，其運作方式較為靈活，可在獲得較高收益的同時而風險較小。