庫藏股屬於所有者權益類，庫藏股屬於權益的備抵類，庫藏股借方登記增加，貸方登記減少。
註銷庫藏股，按股票總面值和註銷的股數借記“權益”科目，按註銷庫藏股的賬面余額借記“庫藏股”科目，按差額貸記“資本公積-股本溢價”科目。股權溢價不足沖減的，借記“盈余公積”和“利潤分配——未分配利潤”科目。如果差額是貸方，貸記“資本公積-股本溢價”科目。
條目是:
當回購價格高於回購股份的總面值時:
借:股本(註銷股份的總面值)
資本公積-股本溢價
功能過剩
利潤分配-未分配利潤
貸:庫藏股(取消庫藏股賬面余額)
當回購價格低於回購股份的總面值時:
借:股本(註銷股份的總面值)
貸:庫藏股(取消庫藏股賬面余額)
資本公積-股本溢價(差額)