1、股票區別：深交所股票分為三類：以000，001開頭的是深圳主板，以002開頭的為中小板；以300開頭的為創業板。而上交所股票代碼以6開頭，全部都屬於主板。
2、開戶方式區別：深交所創業板需要滿足條件單獨開通。而上交所開通即可交易所有上交所上市的股票。
3、過戶費區別：深交所沒有過戶費。而上交所需要收取1元的過戶費。
上交所，全稱為上海證券交易所，是壹個為證券集中交易提供場所和設施，組織和監督證券交易，實行自律管理的不以營利為目的法人。上交所歸屬中國證監會直接管理，與深圳證券交易所並稱中國大陸兩所證券交易所，同時也是國際證監會組織、亞洲暨大洋洲交易所聯合會、世界交易所聯合會的成員。而深圳證券交易所（ShenzhenStockExchange，縮寫SZSE，中文簡稱“深交所”）成立於1990年12月1日，是經國務院批準設立的全國性證券交易場所，是為證券集中交易提供場所和設施，組織和監督證券交易，實行自律管理的法人，由中國證券監督管理委員會監督管理。