2000年3月9日在深交所上市,股票代碼000999。公司於2007年6月底正式進入華潤集團。2010年2月,公司名稱正式由三九藥業股份有限公司變更為華潤三九藥業股份有限公司,公司主營業務為中藥非處方藥和處方藥。主要產品有三九胃泰、999感冒靈、999皮炎平、999小兒氨酚、999正天丸、999李強枇杷露、氣滯胃痛顆粒、999參附註射液、999參麥註射液。