按照債券ETF的運作方式，可以分為單市場實物債券ETF和現金債券ETF。
單市場實物債券ETF是指所跟蹤的債券指數的成份股證券為在深交所上市的債券，投資者利用債券組合進行申購贖回的ETF。
現金債券ETF是指跟蹤債券指數，投資者使用全額現金申購贖回的ETF。
如深交所首只債券ETF嘉實中期國債ETF，跟蹤金邊中證國債指數，主要投資剩余期限為4-7年的國債。可以通過基金合同和招募說明書約定的實物、現金替代等方式申購贖回，並在深圳證券交易所上市交易。