參考匯率:港股通交易日每日開市前，由交易所銀行提供並通過聯交所網站向市場公布的匯率。參考匯率包括兩項:港元買入參考價格和港元賣出參考價格。證券交易所和國內證券公司利用參考匯率對投資者的資金進行前端監控。即投資者買入港股時，證券公司以港幣的賣出參考價計算投資者需要凍結的人民幣資金；投資者賣出港股時，證券公司以港幣參考價格計算可供投資者使用的人民幣資金。
結算匯率(Settlement exchange rate):當日收盤後，中國結算計算的匯率以港股通全市場(分別以上海和深圳計算)交易的凈結算(單邊、凈應付或凈應收)為基礎，在香港與兌換銀行進行外匯兌換後，將兌換成本平均分攤到當日所有買賣交易中。