猴痘病毒(MPV)與天花病毒、痘苗病毒、牛痘病毒同屬於痘病毒科正痘病毒屬。MPV是壹種有包膜的線性雙鏈DNA病毒，基因組大小約為197kb，包裹在直徑為140-260nm的啞鈴狀細胞核內。病毒顆粒呈磚狀或橢圓形。MPV基因組具有高度保守的中央編碼區，約56-120 kb，兩側是可變區和末端重復序列。根據遺傳、地理和表型變異，該病毒有兩個不同的分支，即西非和剛果盆地，後者也被稱為中非分支，毒性最強。通過全基因組測序，已經知道2022年傳播的病毒屬於輕度西非分支。
因為MPV感染的臨床表現與其他痘病毒引起的疾病很難區分。因此，快速有效的實驗室檢測方法對控制MPV的爆發非常重要。
①聚合酶鏈反應
PCR是檢測猴痘病毒DNA的首選方法。壹般來說，通常選擇外膜蛋白基因(B6R)、DNA聚合酶基因E9L和依賴DNA的RNA聚合酶亞基18。(RPO18)基因的保守區和補體結合蛋白C3L、F3L和N3R基因用作PCR擴增的靶。PCR診斷樣本可直接來自皮膚、液體或痂。此外，重組聚合酶擴增(RPA)、環介導等溫擴增(LAMP)和限制性片段多態性(RFLP)也被開發用於MPV DNA檢測。
②血清學實驗
酶聯免疫吸附試驗(ELISA)可以檢測患者血清中的特異性IgM和IgG抗體。由於MPV與其他痘病毒之間存在抗原交叉反應，該方法特異性較低。
③電鏡觀察
通過電子顯微鏡可以觀察到病毒的形態特征。同樣，由於MPXV在形態學上與其他poxv病毒難以區分，因此這種方法缺乏準確性。另外，電鏡觀察靈敏度不高，樣品制備復雜，周期長。
④其他方法
免疫化學分析和多重免疫熒光成像可用於MPV抗原檢測。