股票質押是以股票等有價證券作為質押獲得融資資金的壹種方式。從兩者的定義可以看出，融資融券和股票質押融資的聯系在於兩者都是融資手段，都需要壹定的抵押物。大多數情況下，雙方都用股票做抵押。然而，這兩者都對證券市場的資金流動產生重大影響。以前證券市場還不成熟的時候，甚至有人用融資融券，股票質押融資？融資？不分開，互相代替。相對於國家股票質押融資和融資融券的規範制度，市場逐漸將這兩個概念區分得比較清晰。這大概是兩者最大的區別。融資融券交易意味著獲得的資金通常必須用於購買上市證券。在壹定條件下，它可以增強證券市場的流動性，加速證券市場的價值發現功能。股票質押融資則不同。募集資金不得用於購買上市證券。當然，對於具體的融資主體，國家會對募集資金的使用有壹定的要求。比如證券公司通過股票質押融資獲得的資金，只能用於彌補營運資金的不足，不能挪作他用。可見，融資融券與資本市場的關系更為密切，而股票質押融資可能既涉及資本市場，也涉及實體經濟。此外，股票質押融資還有壹個類似的概念，即股權質押融資主要是指非上市公司提供的股權來擔保融資資金。
就個人投資者而言，如果融資的目的是買股票，融資融券和股票質押融資可以達到同樣的效果，但對機構投資者的效果不同。比如融資融券業務的收入渠道和利潤增長點的拓展都是基於證券公司的創新產品，而股票質押融資的盈利能力對於證券公司來說並沒有改變，募集資金只能用於補充流動資金的不足。