1、證券交易所的地點：滬市是上海；深市是深圳。
2、板塊不同：滬市只有主板與B股；深市有主板、中小板、創業板和B股。
3、股票代碼不同：滬市主板是60開頭，B股是900開頭；深市主板是000開頭，中小板是002開頭、創業板是300開頭、B股是200開頭。
4、B股標價不同：滬市是以美元競價；深市是以港幣競價。
5、交易制度不同：基本的交易規則是壹致的，差別在於收市最後3分鐘（14：57~15：00），具體在於滬市的交易規則是連續競價；深市的交易規則是集合競價。
6、托管不同：滬市是采取的指定交易，也就是妳在設立證券帳戶的時候要先選定壹家證券公司作為委托對象；深市則采取的“自動托管，隨處通買，那買那賣，轉托不限”。
上證與深證的概念
1、上海證券交易所（英文：ShanghaiStockExchange）是中國大陸兩所證券交易所之壹，創立於1990年11月26日，位於上海浦東新區。
1990年12月19日上海證券交易所開始正式營業。截至2009年年底，上證所擁有870家上市公司，上市證券數1351個，股票市價總值184655.23億元。壹大批國民經濟支柱企業、重點企業、基礎行業企業和高新科技企業通過上市，既籌集了發展資金，又轉換了經營機制。
2、深圳證券交易所（以下簡稱“深交所”）成立於1990年12月1日，是為證券集中交易提供場所和設施，組織和監督證券交易，履行國家有關法律、法規、規章、政策規定的職責，實行自律管理的法人。
深交所的主要職能包括：提供證券交易的場所和設施；制定業務規則；審核證券上市申請、安排證券上市；組織、監督證券交易；對會員進行監管；對上市公司進行監管；管理和公布市場信息；中國證監會許可的其他職能。