擔保證券是以某種方式保證還本付息的證券。擔保證券主要指公司發行的擔保債券。
標的證券是投資者通過融入資金可以買入的證券，也是證券公司可以借給投資者的證券。證券交易所應當按照由嚴到寬、由小到大、逐步擴大的原則，根據融資融券業務試點的進展情況，在證券交易所規定的證券範圍內審核選擇試點初期的標的證券名單，並向市場公布。
2.內容上的差異
擔保證券包括財產擔保和第三方擔保。信托銀行壹般會對抵押物進行評估，包括抵押物在市場價格下的價值、抵押物的未來收益等。，只適用於信譽高的大企業；第三方擔保是指政府、有信譽的銀行或發債公司的母公司作為擔保人。
標的證券的主要內容是證券交易所規定融資買賣標的證券，僅限於上市股票、證券投資基金、債券以及其認可的其他證券。根據市場情況調整標的證券的選擇標準和清單，並根據雙方約定對相關融資融券交易進行結算。若標的證券進入退市程序，則在自發行人做出相關公告的當日進行調整。
3.資格上的差異。
有擔保證券的合格條件是，發行公司到期不能還本付息的，必須處置抵押物，變價收入用於清償債務。還有就是發行由公司全部財產擔保的債券；當債務不能按時償還時，由擔保人代為償還。
標的證券應當符合在證券交易所上市交易滿3個月的條件；融資買入標的股票流通股本不低於65，438億股或流通市值不低於5億元，融券賣出標的股票流通股本不低於2億股或流通市值不低於8億元；股票發行公司的股東人數不少於4000人；近三個月日均換手率不低於基準指數日均換手率的20%。
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