DNA微陣列又稱DNA陣列或DNA芯片,更通俗的叫法是基因芯片。它是塗有DNA微陣列的特殊玻璃片。在幾平方厘米的面積上安裝幾千或幾萬個核酸探針,壹次測試就可以提供大量的基因序列相關信息。它是基因組學和遺傳學研究的工具。利用基因芯片,研究人員可以同時定量分析大量(數千個)基因的表達水平,具有快速、準確、低成本的生物分析能力。
哪種cDNA可以用來檢測基因表達的程度?CDNA微陣列已經商業化,市場主要是R&D實驗室。此外,通過光刻技術檢測基因多態性的生物芯片仍處於實驗階段,而結合微流控技術的臨床診斷芯片仍處於研發階段。
DNA微陣列技術;
1.檢測基因表達水平,鑒定基因序列。
在1996中,Schena等人利用擬南芥光調制基因微陣列,以不同器官中的mRNA為探針,檢測基因表達水平。結果表明,葉片中的mRNA表達水平是根中的500倍。Shelon等人在1996將釀酒酵母的基因組DNA克隆到微陣列中,用6條最大染色體和10條最小染色體DNA探針分別標記紅色和綠色熒光標記進行雜交檢測。結果表明,95%的克隆位於與文獻報道壹致的染色體上。Milosaljevic等人在1996中將大腸桿菌基因組DNA的15328個克隆制成微陣列,用997個寡核苷酸探針進行雜交檢測。通過計算機將匯總結果與大腸桿菌序列數據庫進行比對,利用該技術可以壹次鑒定出4.6MbDNA的序列結構。
2.檢測表達和發現新基因。
Wodicka1997、覆蓋酵母基因組所有orf的26萬種25聚體探針排列在4張載玻片上,每張載玻片上有6.5萬個探針。將酵母分為富酵母和低酵母兩組,研究不同生長條件下的基因表達水平。結果表明,90%的基因在兩種條件下均有表達,36種mRNA在豐富培養中表達較多,65,438+040種mRNA表達較少。此外,還發現了壹些尚未報道的新基因。
3.用於遺傳作圖的突變和多態性檢測。
Hacia等用96600寡核苷酸陣列檢測196中人癌基因BRCA1的突變,用兩種熒光分別標記15患者樣本和對照樣本。發現14人的基因有壹個剪輯突變,* * *呈現8個多態性,突變表達在基因外顯子2的第22位密碼子。利用SNP制作人類基因圖譜將是第三代基因圖譜,完全基於DNA微陣列。第四,DNA序列分析。Donnel等1992,Pease等1994,Yershow等1996,Wallraff等1997都報道了DNA微陣列技術用於DNA序列分析。大多數研究人員使用合成的寡核苷酸序列制作微陣列,然後與標記的未知DNA序列雜交,用熒光聚焦顯微鏡掃描和計算機軟件分析獲得數據。壹些研究人員還用標記的寡核苷酸作為探針對待測DNA片段陣列進行雜交和測序。