公司成立後，嚴格按照《公司法》和現代企業制度的要求規範運作，通過采取壹系列措施避免與大股東之間的同業競爭、減少關聯交易。在新的管理模式下，公司建立了高效完善的組織結構，使技術、信息、資金、人才等資源得到充分合理的利用，實現了公司的獨立運作，具有了面向市場自主經營的能力，取得良好的經營業績。
2001年3月末，公司順利通過沈陽證管辦的驗收，同時取得遼寧省政府上市推薦函，通過省政府金融辦的審核。2001年10月19日，公司首次發行股票的申請壹次全票通過中國證監會審核。2002年1月16日，公司首次公開發行1億股A股股票，發行價格5.90元/股。2002年1月31日，公司股票在上海證券交易所掛牌上市，股票代碼：600317。
公司於2002年3月完成收購營口港鮁魚圈港區二期工程、壹期工程309米深水岸線泊位和散糧中轉設施工程，並設立了壹、二兩個分公司。收購完成後，公司資產規模由2001年底的3.86億擴大到2002年底的12.12億，泊位由成立時的6個增加到13個，泊位的吞吐能力進壹步提高。改造後的原27#與26#泊位合稱為26#泊位可接卸15萬噸級礦粉船，2002年度公司***接卸13艘開普賽型船舶，首開東北口岸接卸大型散貨巨輪的先河。
為進壹步擴大港口規模，增強公司的核心競爭力，在對各種融資方式進行比較後，公司最終確定以發行可轉債的方式進行二次融資
。2004年3月15日，公司發行可轉債的申請通過中國證監會發審委審核。2004年5月20日，公司7億元可轉債順利發行，6月3日，公司可轉債在上海證券交易所上市交易，轉債代碼：110317。可轉債發行後，公司用募集資金收購了三期工程多用途泊位和成品油及液體化工品碼頭。為避免同業競爭和進壹步減少關聯交易，2004年6－7月，公司收購了營口中遠國際集裝箱碼頭有限責任公司50%的股權、營口港實業發展有限責任公司99.44%的股權，並整體收購了營口港務集團汽車運輸公司。收購完成後，公司開始介入收益良好的集裝箱業務。按照國家關於股權分置改革的要求，公司於2005年9月份制訂了股權分置改革草案，開始進入申報程序，11月末取得遼寧省及吉林省國資委的原則同意。12月29日，股改方案經公司2005年第二次臨時股東大會暨相關股東會議以98.93%的比例通過。1月17日，公司完成股權分置改革。
隨著中國加入WTO，及振興東北老工業基地等國策的大力推動，營口港面臨歷史性的發展機遇。公司的規模將進壹步擴大，效益也將進壹步提高。公司將利用自有資金、銀行貸款和向資本市場的融資能力，不斷改造現有生產泊位的吞吐能力。同時，根據公司的發展方向和經營情況，加快鮁魚圈港區四期工程、大型礦石碼頭、原油碼頭以及物流園區等項目的建設，進壹步提高公司的吞吐能力。針對激烈的競爭形勢，在充分發揮港口區位、自然條件等優勢的基礎上，健全港口主體功能，向專業化、大型化、集裝箱化的現代化港口方向發展，生產經營泊位由通用型向專業型泊位轉化，提高業務競爭力；同時，本公司將進壹步規範經營管理，積極開拓，不斷創新，建設更有成效的團隊和優秀的企業文化；積極與國內外知名的船公司、貨主、跨國集團公司開展多種形式的戰略聯合，努力實現港口投資經營多元化，提高公司的綜合競爭力。