兩者的監管區別:場內資本市場的監管要求非常嚴格，證監會和交易所是主要的監管機構。上市公司需要嚴格、準確地按時披露季度和年度財務報告以及各種重大事項。而場外資本市場的上市公司，監管要求相對寬松，監管機構主要是地方金融辦和交易中心本身，主要針對機構投資者的民間融資。
中介機構的區別:場內資本市場掛牌需要雇人(壹券三分)；經紀人，會計師事務所，律師事務所，資產評估師等等。
不需要聘請券商在場外資本市場上市，稱為(壹代兩司)；代理，會計師事務所，律師事務所。大多數企業上市不需要聘請評估師。
股東人數的區別:場內資本市場上市後的股東人數沒有限制，但場外資本市場上市的股東人數，尤其是國內最多不能超過200人，如果是有限責任公司，不能超過50人。
融資對象的不同:人數不限，意味著適合所有投資人投資，融資金額大的可能性更大。200或50人以內意味著上市公司只能尋找高凈值投資人和風險投資機構。因此，我們稱場外資本市場為專業機構市場。即專門針對專業投資機構和專業個人投資者。
交易時間和地點的區別:場內資本市場上市的交易時間為股票的開市和收盤時間，而場外資本市場的上市公司可以是全球任何地方，交易時間為24小時，以民間融資和協議轉讓為主。當然，新三板掛牌還有做市商交易制度和集合競價交易制度。
企業規模差異:壹般來說，場內資本市場的上市企業規模較大，由於對上市利潤有明確要求，企業相對成熟。因為場外市場沒有利潤要求，大小都有。由於在國內上市難度很大，上市時間不確定，壹批利潤已經達到甚至超過場外資本市場上市公司的企業也選擇在全國股轉系統(新三板)掛牌，所以規模不是絕對的。