壹、支付對象範圍不同：
1、股份支付是企業與職工或其他方之間發生的交易。以股份為基礎的支付可能發生在企業與股東之間、合並交易中的合並方與被合並方之間或者企業與其職工之間。
2、應付職工薪酬是企業根據有關規定應付給職工的各種薪酬，包括工資，獎金，津貼，補貼。是指企業為獲得職工提供的服務而給予各種形式的報酬以及其他相關支出。
二、支付項目不同：
1、應付職工薪酬包括：職工工資、獎金、津貼和補貼；職工福利費；醫療保險費、養老保險費、失業保險費、工傷保險費和生育保險費等社會保險費；住房公積金；工會經費和職工教育經費；企業以自產產品或外購商品發放給職工作為福利，或者向職工提供企業壹定補貼的商品或服務等。
2、股份支付項目包括：以權益結算的股份支付，以權益性結算的股份支付又包括限制性股票和股票期權。以現金結算的股份支付包括模擬股票和現金股票增值權。這兩者都與股票掛鉤，但是不需要實際授予和持有股票。
三、支付目的不同：
1、股份支付是以獲取職工或其他方服務為目的的交易。企業在股份支付交易中意在獲取其職工或其他方提供的服務(費用)或取得這些服務的權利(資產)。企業獲取這些服務或權利的目的是用於其正常生產經營。不是轉手獲利等。
2、應付職工薪酬是按相關法規應付給職工的各種薪酬。企業按照有關規定向職工支付工資、獎金、津貼等，借記"應付職工薪酬"，貸記“銀行存款”、“庫存現金”等科目。
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