此項業務遵循“券商管理證券，銀行管理資金”的原則，即券商管理證券，銀行管理資金，投資者的證券賬戶和證券保證金賬戶嚴格分開管理。
第三方存管全稱是“客戶交易結算資金第三方存管”，是商業銀行以第三方存管方式提供的業務，出現在期貨、證券、房地產等交易活動中。
證券交易第三方存管是指受托銀行依據法律法規對客戶的資金交收和存取進行管理，但不改變證券交易的運作。
在之前的證券交易中，資金的交割和存管由證券公司統壹保管，後來證監會規定由第三方存管機構保管，壹般是有存管資格的商業銀行。
第三方托管的好處:
更加無憂的訪問:
起初，由於證券交易所的統壹存管，資金的存取以及銀行賬戶與保證金賬戶之間的轉賬只能通過券商進行。現在有了第三方存管，客戶可以通過網上銀行、銀行櫃臺、電話銀行等多種方式辦理。
資金更有保障:
以前客戶的存款由證券公司保管，經常會發生客戶存款被拒的情況。有了現有的第三方商業銀行進行存管，客戶的存款有了券商和商業銀行的雙重保護，客戶的資金可以得到更好的保障，也更放心。
服務更貼心:
第三方托管後，客戶不僅可以投資證券公司，還可以了解銀行投資項目，選擇更多的投資理財服務。
便於國家監控非法資金:
目前保證金由商業銀行統壹保管，更便於國家監控資金來源，發現非法資金。