因為人民幣不可自由兌換，換句話說，中國的資本賬戶無法在全球自由流動。人民幣持有者在國內只選擇a股，a股市場投機氛圍濃厚。因此，a股的股價大部分時間都高於h股。這是相對的，它的存在是合理的，不影響a股的炒作。未來隨著人民幣的完全可兌換，這種情況將會消失。我們會看到的是上市公司基本面對應的股價波動。由於市場分割，A-H溢價可以存在而不會被套利消除。也就是說，買入的a股不能在香港賣出。而且對於股票等金融資產來說，有壹個固有的缺陷，就是很難像衍生品壹樣進行無風險套利(見看跌期權平價)。從邏輯上講，市場分割導致了套利難度的限制。這樣壹來，即使同樣的股票價格相差很大，也不壹定會收盤。可以類比，這相當於在壹個池子中間加了壹個大壩。
承認了市場細分之後，我們就可以談談為什麽價格不壹樣了。可以比喻為為什麽水位不壹樣。根據傳統的金融理論，股票的價值應該等於投資者預期未來現金流的現值乘以合理的風險調整貼現率。如果市場是有效的，那麽股票的價格是由價值決定的。如果用可持續增長模型(GGM)來分析，即P=V=E(CF)/r-g，那麽股價將由以下因素決定:1)投資者對未來現金流的預期。2)折現率不同。因此，可以說A-H股股價的差異可能來自於投資者對未來現金流的不同預期。比如a股的投資者就比較樂觀。
展開:
投資者投資a股關註中國內地企業發展、行業前景、中國政策走向，規避散戶投資者的風險，這與h股的中國股票交易沒有直接關系。除非雙方信息不對稱，或者中港之間有協調或者政策變化。投資h股的投資者關註的是商業走勢、行業前景、國際形勢以及國際市場的發展和潛力。而且港股和美股基本是聯動影響的，a股走勢受影響較小。
首先，兩個市場的流動性不同。雖然a股開閘越來越寬，但與香港市場完全自由開放相比，還是有很大差別。特別是有很多資金不能自由對外投資，只能在a股尋找投資標的，客觀上造成更多的資金追逐更少的股票，而港股的流動性受國際市場影響，進出並不少見。整體來看，a股流動性比h股更充裕，資金“水位”較高也帶來了溢價。
第二，內地投資者進入港股仍有障礙。目前內地投資者通過滬港通、深港通投資港股有限制，開通該功能有50萬的資金門檻，實際上已經將絕大多數內地投資者排除在外。此外，港股通交易成本較高，交易時間僅限於兩地股市同時開市的時間，也在壹定程度上影響了內地投資者的比例。
第三，a股本身存在溢價因素。首先，目前a股的申購需要二級市場的股票市值進行配售，同時新股上市初期持續上漲，因此存在無風險套利，因此a股也被賦予了壹定程度的“看漲期權”，這是港股所不具備的。此外，a股和h股之間還存在“控制權溢價”。目前在兩地上市的公司中，只有中國建設銀行是h股全流通，其余都是a股全流通。因此，a股的控股股東天然具有“控制權溢價”，即能夠以較少的股份控制上市公司的經營，因此其股權相對於其他普通股具有隱形溢價，這在民營企業或第壹大股東持股比例較低的公司中尤為明顯。
第四，部分新股上市之初的大幅炒作，擡高了a股的溢價。最近兩年上市的新股中，包括新華文軒、中原證券、中國銀河、秦剛、莊園牧場、拉夏貝爾等。，a股上市之初得到大炒，而h股大多在短期內反應上漲，很快回落到原來的位置，導致AH股整體溢價擴大。
第五，兩地投資者結構不同。整體來看，港股市場機構投資者尤其是境外投資者的比例較高，擁有定價權。不過，雖然近年來a股市場機構投資者占比不斷增加，但散戶仍占較大比重，小盤股和題材股定價高於港股，也增強了兩地估值差異。
整體而言，在兩地股市的現狀下，a股相對於h股存在溢價是正常合理的。當然，隨著未來兩地股市的進壹步融合，包括交易機制的趨同和投資者結構的接近，溢價收窄並穩定在小範圍內也是可以預見的結果。目前a股明顯比h股貴，要註意折價的a股，反之。