基因芯片技術應用領域主要有基因表達譜分析、新基因發現、基因突變及多態性分析、基因組文庫作圖、疾病診斷和預測、藥物篩選、基因測序等。另外基因芯片在農業、食品監督、環境保護、司法鑒定等方面都將作出重大貢獻。基因芯片的飛速發展引起世界各國的廣泛關註和重視。 鑒於基因芯片的巨大潛力和誘人的前景，基因芯片已成為各國學術界和工業界研究和開發的熱點。尤其在美國，正處於人類基因組計劃以來的第二次浪潮之中，美國總統克林頓在1998年1月的國情咨文中指出：“在未來的12年內，基因芯片將為我們壹生的疾病預防指點迷津”。1998年6月29日美國宣布正式啟動基因芯片計劃，聯合私人投資機構投入了20億美元以上的研究經費。世界各國也開始加大投入，以基因芯片為核心的相關產業正在全球崛起，美國已有8家生物芯片公司股票上市，平均每年股票上漲75%，專家今統計：全球生物芯片工業產值為10億美元左右，預計今後5年之內，生物芯片的市場銷售可達到200億美元以上。美國財富雜誌載文：在20世紀科技史上有兩件事影響深遠，壹是微電子芯片，它是計算機和許多家電的心臟，它改變了我們的經濟和文化生活，並已進入每壹個家庭；另壹件事就是生物芯片它將改變生命科學的研究方式，革新醫學診斷和治療，極大地提高人口素質和健康水平。鑒於生物芯片技術具有巨大理論意義和實際價值，基因芯片研究在國內也有了很快的發展，例如，復旦大學、中科院上海冶金所、清華大學、聯合基因有限公司、軍事醫學科學院、中科院上海細胞所等單位已在生物芯片技術方面取得了較大突破，相信不久將有我國生產的生物芯片產品投放市場。
總之，以基因芯片為代表的生物芯片技術的深入研究和廣泛應用，將對21世紀人類生活和健康產生極其深遠的影響。