經濟適用房與棚戶區改造的優惠政策區別如下：
1、價格不同：經濟適用住房的市場利潤被限在3%以下限價房，《房地產開發經營業務企業所得稅處理辦法》第八條規定，明確棚戶區改造使用經濟適用房稅收優惠政策，計稅毛利率不得低於3%，出售經濟適用房實行政府指導價其售價由市。
2、產權不同：經濟適用房具有社會保障性質的商品住宅，購房人擁有有限產權，棚戶區改造是壹項工作，產權指的是具體安置房項目的產權。
3、概念不同：棚戶區改造是我國政府為改造城鎮危舊住房、改善困難家庭住房條件而推出的壹項民心工程，經濟適用住房是以微利價出售的商品房。
擴展資料1、經濟適用住房由國家統壹下達計劃，用地壹般實行行政劃撥的方式，免收土地出讓金，對各種經批準的收費實行減半征收，出售價格實行政府指導價，按保本微利的原則確定
2、經濟適用房是國家為解決中低收人家庭住房問題而修建的普通住房，這類住宅因減免了工程報建中的部分費用，其成本略低於普通商品房，需年收入小於等於6萬的家庭，當地戶口才可購買。
3、棚戶區改造安置住房實行原地和異地建設相結合，以原地安置為主，優先考慮就近安置；異地安置的，要充分考慮居民就業、就醫、就學、出行等需要，配套設施齊全地段。
4、棚戶區改造涉及集體土地征收的，要按照中國國家相關法律法規，做好土地征收、補償安置等前期工作。各地區可以探索采取***有產權的辦法，做好經濟困難棚戶區居民的住房安置工作。
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