行權價格與權證價格密切相關，行權價格依附於權證。對於認沽權證，當行權價格高於行權期間的證券價格時，權證具有內在價值；對於認股權證，當行權價格低於證券價格時，認股權證具有內在價值。
比如滬深300股指行權價為4000點的看漲期權合約，賦予買方在合約到期日以4000點的價格買入滬深300股指的權利。看漲期權合約的買方在合約到期日行使權利，以4000點的價格買入滬深300指數，稱為行權。授予時行權價格的設定:不同的行權價格會導致股票期權是價外、價內還是價內。其中的區別在於期權在發行時是否具有內在價值。虛擬期權是指期權的行權價格高於期權發行時股票的市場價格，期權的內在價值為負。實物期權是指期權的行權價格低於股票發行時的市場價格，期權具有內在價值。平價期權是指期權的行權價格等於期權發行時股票的市場價格，內在價值為零。不同的選擇會對期權發行時是否有壹筆收益產生影響。如果把股票期權作為壹種激勵手段，著眼於企業未來的業績和股價的上漲，期權的行權價格應該等於或高於當前的股票市場價格，那麽期權就成了平價期權或虛擬期權。如果將股票期權作為壹種福利工具，或者作為管理層和員工薪酬的組成部分，那麽期權的行權價格應該低於當前的股票市場價格，即應該向員工發放實物期權。
如果我們著眼於激勵，在授予期權時，行權價格應該定得高於市場價格。當股票市場整體波動時，行權價格應隨整個市場(如股票指數)的波動而調整或掛鉤。通過管理層和員工的努力，為股東創造價值，讓管理層和員工分享股東價值提升帶來的利益。如果我們著眼於福利，在授予期權時，行權價格定得低於或遠低於市場價。無論未來股價如何波動，管理層和員工都可以以股票期權計劃的名義輕松獲得壹筆收入。現實中，不同國家/地區對上市公司股票期權計劃的行權價格做出了不同的規定。最後，由於非上市公司沒有二級股票市場形成股票價格，如果非上市公司也設計股票期權計劃，則必須確定行權價格。如果選擇公司經審計的每股凈資產值；或者設計的加權指數。