1，意為差異:
公募基金是由政府主管部門監管，向不特定投資者公開發行受益憑證的證券投資基金。在法律的嚴格監管下，這些基金有信息披露；資金專戶作為資產管理人向特定客戶歸集資金或者接受特定客戶的財產委托，商業銀行作為資產托管人。為了資產托管人的利益，將委托財產用於證券投資的活動稱為專戶理財。與公募基金相比，公募基金專戶的產品設計靈活性更高，產品種類比公募基金更多，產品設計更細致。公募基金專戶的財務績效評價多以絕對收益為基礎，而公募基金的財務績效評價多以相對收益為基礎。
2、產品設計和服務不同:
公募基金是標準化的理財產品，專戶理財走的是差異化、個性化的道路。其主要魅力在於基金公司為高端客戶提供定制化服務。
3.不同的財務目標:
公募基金業績以比較基準衡量，追求相對超預期的年化預期收益，專戶理財追求絕對預期年化預期收益；
4.費率結構有所不同:
相比於公募基金中固定費率的管理費率，專戶理財的費率更加靈活，壹般為“固定+浮動”，即在收取壹定費率的基礎上，業績獎勵不高於凈預期年化預期收益的20%。
5.不同的流動性:
與公募開放式基金可隨時贖回的情況不同，基金公司開展專戶理財業務時，與投資者簽訂的資產管理協議期限壹般在1年以上，期間不開放或限制申購贖回。
6.不同的飼養方式:
公募基金的募集不需要投資者簽訂任何合同，而壹對多專戶理財則需要資產委托人、資產管理人和資產托管人共同簽訂書面資產管理合同，明確約定各自的權利、義務和相關事項。
7、投資限制和投資策略不同:
公募基金的投資比例有壹定限制，有最低股票持倉限制，所以投資組合必須分散，通常是投資組合勝出；在符合法律法規的前提下，專戶理財對投資股票的倉位限制很少，甚至是空倉，投資比例相對集中。通常選擇個股取勝。