專項應付款科目是核算企業取得政府作為企業所有者投入的具有專項或特定用途的款項。本科目可按資本性投資項目進行明細核算。
1、企業收到專項撥款時，
借：銀行存款
貸：專項應付款
2、將專項或特定用途的撥款用於工程項目，
借：在建工程
貸：銀行存款
應付職工薪酬
3、工程項目完工形成長期資產的部分，
借：專項應付款
貸：資本公積---資本溢價?
4、對未形成長期資產需要核銷的部份
借：專項應付款
貸：在建工程”等科目
5、撥款結余需要返還的，
借：專項應付款
貸：銀行存款
6、上述資本溢價轉增實收資本或股本，
借：資本公積----資本溢價或股本溢價
貸：實收資本”或“股本”
專項應付款科目期末貸方余額，反應企業尚未轉銷的專項應付款。
擴展資料
所謂專項資金，是國家或有關部門或上級部門下撥行政事業單位具有專門指定用途或特殊用途的資金。這種資金都會要求進行單獨核算，專款專用，不能挪作他用。並需要單獨報帳結算的資金。在當前各種制度和規定中，專項資金有著不同的名稱，如專項支出、項目支出、專款等，並且在包括的具體內容上也有壹定的差別。但從總體看，其含義又是基本壹致的。
專項資金有三個特點：壹是來源於財政或上級單位；二是用於特定事項；三是需要單獨核算。專項資金按其形成來源主要可分為專用基金、專用撥款和專項借款三類。
壹、專項資金實行“專人管理、專戶儲存、專賬核算、專項使用”。
二、資金的撥付本著專款專用的原則，嚴格執行項目資金批準的使用計劃和項目批復內容，不準擅自調項、擴項、縮項，更不準拆借、挪用、擠占和隨意扣壓；資金撥付動向，按不同專項資金的要求執行，不準任意改變；特殊情況，必須請示。
三、嚴格專項資金初審、審核、審核制度，不準缺項和越程序辦理手續，各類專項資金審批程序，以該專項資金審批表所列內容和文件要求為準。
四、專項資金報賬撥付要附真實、有效、合法的憑證。
五、加強審計監督，實行單項工程決算審計，整體項目驗收審計，年度資金收支審計。
六、對專項資金要定期或不定期進行督查，確保項目資金專款專用，要全程參與項目驗收和采購項目接交。
參考資料：
百度百科專項資金