法律制度的缺失以及配套制度的不健全，使得我國公司型基金沒有生長的土壤。目前我國現存的60多只基金均為契約型基金，幾年前曇花壹現的公司型基金“淄博基金”悄然改為了契約型基金。但現在契約型基金的要進壹步發展卻舉步維艱，不僅三分之二的基金經營處於虧損狀態，甚至基金的發行過程中出現了硬性攤派現象，而且出現了個別基金管理人濫用權利、違規操作，如“青啤事件”、“深高速事件”。最後，契約型基金的投資品種、操作理念幾乎“千人壹面”、同質化，機構投資者的個性化服務缺失，造成市場對此類基金投資欲望普遍下降。同時，公司型基金卻在實際上又完全無法操作、無法改變這種局面。
目前，公司型基金的問題主要表現在如下方面：
壹、公司型基金的法律空缺：“國務院另行規定”尚未出臺，公司型基金的實際運作受到《公司法》、《基金法》、《信托法》三者的制約，但都沒有給出明確的界定。這樣多方權利和義務不明確，弊端很多，可操作性低。基金運作的合理的成本、定期報告、內部控制機制、業績表現的評價等諸多方面很難形成流暢的市場化運作。
二、對投資基金的稅收政策仍然空缺：按照《公司法》規定，公司型基金在稅收上與壹般企業同等對待，必須繳納營業稅和企業所得稅等高稅額。總和近50%的企業所得稅和營業稅，使得公司型基金不堪重負，喪失了市場運作的可操作性，與契約型公募基金更不在同壹起跑線上，這在實踐上導致了機構投資市場只能限於很窄的契約型公募基金和地下眾多的“投資顧問”小賬戶，阻礙了機構投資市場的專業化、效率和規模的健康發展。
三、公司型基金的申購和贖回完全不具有操作性：工商登記過程中的增資減資手續過度繁瑣和漫長。對於公司型基金這種特殊類型的“投資公司”，增資和減資手續也與壹般企業相同，增資的工商手續需要個5工作日，減資需要在省級以上報紙上公告45日後才可開始工商手續，工商手續還需要5個工作日。如此漫長的工商手續，使得公司型基金難以捕捉市場機會。盡管我們在與工商登記部門的調查中曾經確認過，對這類特殊“投資公司”完全可在3日內完成增減資手續，實現與國際上的T＋3處理接軌。
四、上海證券交易所的分倉結算上還不到位：機構投資人通常買賣金額大，通過分倉下單，是發達市場必備的機能。分倉下單有很多好處，包括減少對市場的沖擊、避免可能發生的操縱市場行為、增強券商的服務水平和競爭力等。深圳證券交易所已經可以分倉結算，但是由於設計問題，在目前的實踐中，大多數投資機構采用多購買席位、或者多設立賬戶的辦法解決，這壹方面提高了運作成本，另壹方面在托管行的基金凈值估值上造成不可操作性，同時多席位、多賬戶使得監管部門無法了解基金持倉的全體情況，我國托管行專業水平的發展也會因此受到嚴重阻礙。從交易所和結算公司角度來看，這在交易和結算過程中無疑也增加了成本和風險。
五、公告體系過於地方化、低效率、高成本：相關操作過程中的“登報”公告，要求省級以上的報刊。這些報紙相對太地方化，並且由於版面等限制，常常造成公告排隊的低效率現象。對於為機構投資提供法律服務的專業部門，收集省級以上報刊上的相關信息進行專業操作、確認十分困難。這些都對建立商業信用體系和高效率的商業運作有負面效果。現行的公告體系無法滿足我國商業活動的專業化要求，更無法滿足公司型基金運作中增資減資的頻繁操作。
機構投資人市場的長期空缺，是我國資本市場投資技能和效率偏低的重要原因，是造成我國資本市場表現與持續高速成長的國民經濟相背離的主要原因之壹。法規不配套也導致了我國機構投資市場采用“曲線救國”的方法，紛紛使用土辦法。結果是專業程度低、進入市場成本高、運作成本高、評估難度大、相關市場環境無法培育成長等。因此，目前我國已經到了必須導入合理的基金法律和制度安排的時候了。