目前基準的疫苗分為兩類，壹類疫苗免費接種，二類疫苗自費接種。自費接種的疫苗屬於預防類的藥品，通常不在醫保的報銷範圍之內。職工醫保個人賬戶不得用於公***衛生費用、體育健身或養生保健消費等不屬於基本醫療保險保障範圍的支出，非免疫規劃疫苗不能由職工醫保個人賬戶支付。
壹般情況下，自費疫苗是不能使用醫保卡進行報銷的。因為醫保基金只能用於國家規定的醫療保險範圍內的醫療費用，而自費疫苗不在醫保範圍內。
醫保的辦理流程如下：
1、參保人攜帶本人有效證件，至鄰近的區縣醫保中心申請辦理，區縣醫保中心當場予以辦結；
2、參保人也可以至鄰近的街道醫保事務服務點申請代為辦理，服務點將在3個工作日內辦結。參保人應在規定時間內至該服務點領取代為辦理的《醫保卡》；
3、參保人可以委托他人代為辦理。被委托人在辦理時需攜帶本人及參保人的有效證件；
4、用人單位集中辦理時，可憑單位介紹信及經辦人本人有效證件至所屬的區縣醫保中心辦理，然後由用人單位將《醫保卡》發給參保人。
綜上所述，不同地區和醫院的政策可能會有所不同，建議咨詢當地的醫保部門或醫院的相關工作人員，了解具體的政策和規定。
法律依據：
《中華人民***和國社會保險法》第二十八條
符合基本醫療保險藥品目錄、診療項目、醫療服務設施標準以及急診、搶救的醫療費用，按照國家規定從基本醫療保險基金中支付。
第二十九條
參保人員醫療費用中應當由基本醫療保險基金支付的部分，由社會保險經辦機構與醫療機構、藥品經營單位直接結算。
社會保險行政部門和衛生行政部門應當建立異地就醫醫療費用結算制度，方便參保人員享受基本醫療保險待遇。