首先希望大家充分了解SC1的劇情(包括母巢之戰的內容)。如果妳不知道或者已經忘記了，我簡單總結壹下:
幾個世紀前，地球上壹部分叛逆的科學家和政治犯來到了另壹個宇宙星系。他們利用了人類特有的堅韌和智慧，在這裏生根發芽，發展壯大。地球人成立了聯邦，後來發現聯邦是個腐敗的政府，於是到處都出現了叛亂分子。我們的主角吉姆·雷諾茲曾經是聯邦所屬的馬薩拉星球上的小警長。有壹天，他收到了求救信號，就帶領隊員去了那裏，結果發現了壹個新種族“外星蟲”(蟲族的官方翻譯)。外星蟲子感染了壹個人類的指揮中心，吉姆不得不摧毀這個指揮中心，卻因“破壞聯邦財產”被聯邦通緝。這時，壹個名為“凱哈之子”的反叛組織收留了雷諾，在那裏雷諾遇到了壹個幽靈特工莎拉·凱瑞甘，他是凱哈之子的首領蒙斯克的副官，並對其產生了好感。在壹次行動中，蒙斯克決心用壹個“靈能傳送者”(幽靈特工、幽靈(神族的官方翻譯)和其他能力，比如潛行，都需要靈能)引誘外星人消滅壹個。
勇氣號是這個星系的原生生物，擁有高端的科技和智慧，但它仍然無法抵禦外星昆蟲的入侵。於是，高階聖殿騎士特薩達去尋找之前被流放的黑暗聖殿騎士，在此期間認識了吉姆·雷諾茲，並獲得了雙方的認可。經過不懈的努力，雙方在壹顆黑暗星球柯拉斯找到了擁有黑暗力量的黑暗聖堂武士，並回到了精靈的母神艾爾。
外星人沒有自己的思維，他們的行為屈從於壹個“主宰”，只有黑暗聖堂武士才能消滅這個主宰和它的腦蟲。在壹次行動中，黑暗聖堂的英雄澤拉圖殺死了腦蟲，但主人趁機知道了艾爾的位置，於是入侵了艾爾，殘存的靈體只好退守到了黑暗聖堂的老家夏古拉斯。
被遺棄的幽靈凱瑞甘不是被蟲族殺死的。主人覺得她的特異功能可以為外星昆蟲服務，於是把它改造成了“刀鋒女王”。凱瑞甘在突變的最後壹刻向吉姆求助，但為時已晚。雷諾到的時候變異已經完成，刀鋒女王放了雷諾，也為以後埋下了伏筆。
幽靈決定和雷諾的遊俠壹起練殺大師，於是經過壹番苦戰，大師終於被消滅，特薩達也和他壹起死了。
刀鋒女王和她的寵臣杜蘭消滅了聯邦首腦，用雙面間諜殺死了聯邦將軍斯圖科夫(母巢人族劇情)。之後，杜蘭消失了，與此同時，刀鋒女王成為了新外星昆蟲的首領，打破了與精靈和聯邦脆弱的休戰協議，殺死了菲尼克斯等“英雄”，也感染了黑暗聖堂的首領。這時，澤拉圖來了，並在女族長的要求下被殺死。刀鋒女王放過了澤拉圖，把殺害同胞和族長的痛苦留給了他，希望他壹生都受此折磨。
凱哈之子成功推翻聯邦，建立新帝國，蒙斯克無疑成為帝國的領袖。新帝國比聯邦更慘，人民苦不堪言。吉姆·雷諾茲的遊騎兵成立抵抗組織收效甚微，而澤拉圖的消失，腐敗的帝國和刀鋒女王蟲群的隱患，這是壹代人的終結。
抱歉打字慢，然後是故事二代的總結(故事動畫在百度百科有，其實更方便。我在這裏補充壹些評論簡單描述壹下。我還是推薦妳玩遊戲或者至少看百科裏的動畫。)
第二代:
四年後，雷諾的遊騎兵依然堅持對抗蒙斯克帝國，收效甚微，而勇氣號則在宇宙中尋找外星昆蟲並消滅它們。
這壹天，雷諾的老朋友特克斯來到了酒吧(也就是在二代預告片裏組裝步槍兵的罪犯)。特克斯聲稱，壹個名為莫比斯基金會的科研組織正在搶奪聯邦政府的“sellner Plus(創始人)”神器，只要他們能得到它，就能賣個好價錢。
所以剩下的就是壹系列星系間的任務，我用支線列出來。
1，移民任務:雷諾收到來自HavenStar的求救信號，在那裏突然遭到消失了四年的外來昆蟲襲擊。許多人受到感染，其余的人急需疏散。在雷諾的幫助下，那裏的居民被成功疏散，雷諾燒毀了被感染的房屋等。HavenStar(戴眼鏡的美女)的領隊漢森博士(Dr. Hansen)入住雷諾旗艦“Huberian”。
移民任務結束有兩個選擇。港灣縣有大量感染者，精神號也已經到達這裏，準備消滅所有感染者。漢森博士表示，他將研發出壹種解毒劑，並希望雷諾阻止Spirit殺害感染者。
如果選擇幫助漢森，漢森最終會帶領恢復的人們重建家園，離開雷諾。離開前，他希望雷諾留下，但雷諾必須繼續革命，拒絕了。漢森親吻雷諾，表達愛意後離開。
如果選擇幫助勇氣號消滅感染者，雷諾最後回到船上，發現漢森博士已經被感染了。她最後的人性要求雷諾殺了她，雷諾別無選擇只能這麽做。
2、隱身任務:在這個系列中，雷諾需要選擇幫助“幽靈部隊”的首領(幽靈和幽靈類似，都可以發射核彈，並且隱形。鬼有3秒範圍的眩暈，鬼是狙擊技能)。雷諾應該選擇幫助幽靈解救那些被帝國扣押的幽靈罪犯，還是幫助Nova(暴雪無限期延遲發售計劃的遊戲星際幽靈)。幽靈的首領承諾在解救人質後加入雷諾打敗蒙斯克，而諾娃則表示幽靈只是壹群殺人不眨眼的狂熱分子。
如果妳選擇幫助幽靈軍，那麽幽靈首領會在結束後帶領幽靈軍加入雷諾的組織，妳可以在以後的戰鬥中訓練幽靈。
如果她選擇幫助諾娃，諾娃在雷諾的幫助下摧毀幽靈訓練營，最後刺殺幽靈首領。作為回報，諾娃把幽靈訓練計劃給了雷諾(沒有告訴帝國)，以便她在未來的戰鬥中訓練幽靈。
3、主線:雷諾和特克斯四處尋找神器碎片，卻意外發現帝國正在摧毀壹個神秘物體。在攔截了他之後，他們發現這其實是聯邦之前使用的那個老舊的機器人副官，而這個副官儲存了蒙斯克在壹代人的時間內拋棄下屬，拋棄凱瑞甘，甚至用不同的昆蟲來摧毀聯邦的證據。經過壹些戰鬥，陰謀和雇傭軍的交易，雷諾破解了副官，並與特克斯壹起向世界坦白真相，並進行抵抗。
雷諾見到了失蹤了四年的黑暗聖堂的首領澤拉圖，並通過他給的記憶水晶得知了未來將要發生的可怕事情。
澤拉圖在這四年中不斷尋找遺失的預言，卻發現刀鋒女王凱瑞甘也在尋找這些古老的預言。在此期間，澤拉圖驚訝地遇到了壹種精神和外星昆蟲的混合生物“混血兒”，壹種擁有護盾、自愈和閃爍、心靈風暴等技能的恐怖生物。預言表明，最終的世界將由這些混血兒統治，人類將首先滅亡，其余的靈將無法抵抗外星昆蟲的大軍而全部滅絕。
然而，當澤拉圖在壹代人的時間裏回到被殺害的主人的身體時，他遇到了在相互毀滅中與他生活在壹起的特薩達的形象。特薩達告訴澤拉圖，這個世界並不是沒有希望的，刀鋒女王這個主人無意中留下了改變未來的希望，因為刀鋒女王不會被混血兒控制，只要有她的外星人軍隊，這個世界還是有救的。
知道了真相，雷諾知道無論如何都要讓凱瑞甘活著，為了他自己，也為了這個世界。
這時，雷諾從塞爾納那裏收集了所有的文物，並把它們交給了“莫比斯基金會”。基金會的負責人是馬魯德博士(納魯德是伏筆，壹代人殺死聯邦將軍斯圖科夫後消失的杜蘭，反過來拼寫是納魯德，暗示是同壹個人，刀鋒女王也看出了他的偽裝)，於是刀鋒女王出面阻止交易。原來他們找到的上古神器，組裝後可以凈化被不同昆蟲感染的人類，但是刀鋒女王和凱瑞甘的記憶是不重疊的，具有雙重人格，所以刀鋒女王還是很害怕這個神器(此段屬於個人理解)。
後來，帝國王儲的兒子蒙斯克出現了。雖然雷諾不喜歡帝國，但他發現王儲並不像他父親那樣野心勃勃。王儲決定幫助雷諾返回夏爾(夏爾壹代也有壹個通行證叫返回夏爾)去尋找刀鋒女王拯救凱瑞甘。在這裏，他遇到了壹個分支:
摧毀查爾上面的平臺。如果妳選擇了這個選項，異形昆蟲就不會在最後的戰鬥中派出長距離的空對地宿主寄生蟲來攻擊妳。
引爆熔融漿彈如果妳選擇了這個選項，在最後壹場戰鬥中，外星昆蟲無法直接運送士兵，甚至無法通過地下的地洞昆蟲直接進入妳的基地。
選哪個不影響劇情，只影響背後的玩法。
神器組裝好後，面對潮水般的異蟲，人類頑強抵抗，最後神器充滿電，凈化了凱瑞甘，把她還給了人類(頭發沒回來，其他都還好)。
這時，特克斯想幹掉弱小的凱瑞甘，因為莫比斯基金會的頭目納魯德就是杜蘭。他為了自己的野心，想殺了刀鋒女王。他利用雷諾的朋友兼囚犯特克斯，秘密告訴特克斯，殺死凱瑞甘會給他真正的自由。
知道真相的雷諾為凱瑞甘擋住了致命的子彈，同時轉身對特克斯扣動了扳機...(這部動畫中，槍響了，但屏幕黑屏，特克斯生死未蔔)。通關後字幕說特克斯死了...但是妳知道。
雷諾和凱瑞甘慢慢走出廢墟，蒙斯克的帝國統治繼續。Spirit還在努力組織結局。SC2的第壹部分，自由之翼，已經結束了。下壹部是資料片《蟲族之心》，目前還未上映，但劇情也大致如此:
回到人類形態的凱瑞甘沒有留在雷諾車隊。在動畫中，新星出現並搶劫了凱瑞甘。逃脫後，凱瑞甘回到了不同昆蟲的巢穴，並在他是刀鋒女王時遇到了他記憶中的化身。為了找回失去的記憶，為了重新組織自己的異蟲部隊以防末日，為了和蒙斯克算總賬，凱瑞甘開始了自己的戰鬥。......