發展定位。面向國家能源戰略需求和世界能源科技前沿，立足山東能源產業發展的重要需求，開展清潔能源科技基礎性、前瞻性和重大關鍵技術創新研究，深入創新“產學研金”體制機制，形成集前沿技術研發、人才集聚培育、優勢產業培育和科技創新服務於壹體的新型國際級R&D機構，繼續為山東能源高質量發展提供強有力的技術支撐
發展目標。用十年左右的時間成為能源技術創新的策源地、能源領域科技創新人才的高地、中科院等相關成果在山東的轉化平臺、清潔能源國家實驗室的重要組成部分。
短期目標。到2023年，聚集以院士、解青、長江學者為領軍人物的約1.600人的高層次人才隊伍，建設光源等先進科學裝置，建成5個以上功能實驗室，轉化山東重大成果60項以上，孵化企業50家以上，爭取國家重點實驗室1個以上，支持生物能源、太陽能、氫能、燃料電池等戰略性新興產業的培育壯大。
建設模式和體制機制。該院是由山東省、中科院、青島市，依托中科院青島能源所，以中科院清潔能源創新研究所為基礎，聯合省內外能源領域的科研單位、高校、企業共同組建的。實行領導小組領導下的院長負責制。院長由中科院青島能源所所長擔任，山東省壹位領導任副院長或副書記。按照中科院下屬研究機構管理，積極探索建設“政產學研金”深度融合的新型研發機構。
重點建設任務。壹是開展先進光源、能源大數據等重大科技基礎設施的預研和建設，爭取未來獲得國家重大科技基礎設施項目。二是聚集20位院士領銜的總規模約1600人的高層次人才隊伍。第三，聯合省內外研究機構和高校，提前建設化石能源、太陽能、生物能、先進儲能、氫能、燃料電池等功能實驗室。四是聯合國家能源集團、神華集團、山東能源集團、兗礦集團、柴蔚集團、北汽新能源汽車青島公司、青島郭萱電池公司等能源龍頭企業，建設約10個產業技術創新中心。第五，加強人才培養體系建設，建立以培養碩士、博士和博士後為重點的人才培養體系，共同培養高層次技術人才和工程人才。六是設立百億級成果轉化及產業化基金，建設壹批產業化示範基地，轉化壹批重大產業化項目。七是探索構建靈活、高效、開放的吸引人和科研組織模式，實行更加靈活的分配和激勵機制，激發科研人員創新活力，促進重大成果產出和轉化。