自2001年7月1日起，個人通過非營利的社會團體和國家機關向農村義務教育的捐贈，在計算繳納個人所得稅時，準予在稅前的所得額中全額扣除。 個人通過非營利性社會團體和國家機關對公益性青少年活動場所（其中包括新建）的捐贈，在計算繳納個人所得稅時，準予在稅前的所得額中全額扣除。
個人將其所得向教育事業和其他公益事業捐贈，在繳納個人所得稅時，可以按照國務院有關規定從應納稅所得額中扣除。但準予扣除的部分必須符合下列條件：
（1）必須是向在中國境內的教育和其他公益事業以及遭受自然災害地區、貧困地區的捐贈； （2）必須通過中國境內非營利的社會團體、國家機關等組織進行，不得直接捐贈；
（3）除特殊規定外，捐贈金額不超過個人所得稅應納稅所得額的30%. 另外，對符合下列捐贈方式（通過非營利性的社會團體和國家機關）的個人捐贈，可以在繳納個人所得稅前全額扣除： 向老年活動機構、教育事業的捐贈；向紅十字事業的捐贈；向公益性青少年活動場所的捐贈；向中華健康快車基金會、孫冶方經濟科學基金會、中華慈善總會、中國法律援助基金會、中華見義勇為基金會、宋慶齡基金會、中國福利會、中國殘疾人福利基金會、中國扶貧基金會、中國煤礦塵肺病治療基金會、中華環境保護基金會用於公益性、救濟性的捐贈。
例如：公民李某2005年3月取得工資收入4000元，將其中200元直接捐贈給四川省某貧困山區失學兒童小紅，通過S區教育局將其中1000元捐贈給P學校；李某同月在A培訓中心講課取得勞務報酬所得8000元，將其中 2000元捐贈給中國紅十字會；工資、薪金所得費用扣除額為800元，李某當月應繳的個人所得稅為：
（1）李某直接對失學兒童的捐贈200元不得在計算個人所得稅前扣除。通過教育局對學校的捐贈，不超過應納稅所得額30%的部分，允許扣除。李某本月工資、薪金應納稅所得額=4000-800=3200元，工資、薪金所得可扣除的捐贈限額=3200×30%=960元。 當月工資應納個人所得稅稅額=（4000-800-960）×15%-125=211元；
（2）李某對紅十字會的捐贈可在應納稅所得額中扣除。勞務報酬應納稅所得額=8000×（1-20%）=6400元。 當月應納勞務報酬個人所得稅稅額=（6400-2000）×20%=880元。 李某當月***應納個人所得稅稅額=211+880=1091元。
個人捐款免稅辦理流程: 依照《中華人民***和國稅收征收管理法》及實施細則的有關規定，納稅人享受減稅、免稅的應當向主管稅務機關提出書面申請，並按照主管稅務機關的要求附送有關資料，經稅務機關審核後，按照減免稅的審批程序經由法律、行政法規授權的機關批準後，方可享受減稅、免稅。 而辦理流程也非常瑣碎：納稅人符合減免稅條件的，應至管轄分局領取並正確填寫《減免稅申請表》，在規定的期限內向管轄分局提出書面申請，並按稅務機關要求提供有關資料，經審核批準的，方可享受減免稅政策。