新農合的報銷主要可以分為門診報銷、住院報銷和大病報銷三類，三類報銷比例如下：
壹、新農合門診報銷比例
1、村衛生室、衛生所報銷比例60%;
2、 鎮衛生院報銷比例40%;
3、二級醫院搏小比例30%;
4、 三級醫院報銷比例20%;
5、 鎮級合作醫療門診報銷限額5000元/年。
二、新農合住院報銷比例
1、新腦電圖、X光透視、拍片、化驗、理療、針灸、CT、核磁***振等輔助檢查項目限額報銷200元;
2、 手術費起付線1000元內按照國家標準報銷，超過1000元按照1000元報銷;
3、 60歲以上老年人住院治療費及護理費每天可報銷10元，限額200元;
4、各級醫院報銷比例為：鎮衛生院報銷60%;二級醫院報銷40%;三級醫院報銷30%。
三、新農合大病報銷比例
1、門診統籌鄉、村補助比例分別提高到65%、75%。
2、 壹級醫療機構住院費用在400元以下者，不設起付線;
3、二級醫療機構補助比例提高到75%~80%;
4、 三級醫療機構補助比例提高到55%~60%。
5、省三級醫療機構補助比例提高到55%。
6、兒童先心病等8種大病新農合補助病種定額的70%，肺癌等12種大病，新農合補助病種定額力爭達到70%。
法律依據：
《新農合報銷範圍》住院補償
報銷範圍：
A、藥費：輔助檢查：心腦電圖、X光透視、拍片、化驗、理療、針灸、CT、核磁***振等各項檢查費，限額200元；手術費（參照國家標準，超過1000元的按1000元報銷）。
B、60周歲以上老人在鎮衛生院住院，治療費和護理費每天補償10元，限額200元。
報銷比例：鎮衛生院報銷60%；二級醫院報銷40%；三級醫院報銷30%。
大病補償
鎮風險基金補償：凡參加合作醫療的住院病人壹次性或全年累計應報醫療費超過5000元以上分段補償，即5001-10000元補償65%，10001-18000元補償70%。
鎮級合作醫療住院及尿毒癥門診血透、腫瘤門診放療和化療補償年限額1.1萬元。
新型農村合作醫療基金報銷支付特殊病種有：惡性腫瘤化療、放療；重癥尿毒癥的血透和腹透；組織或器官移植後的抗排異反應治療；精神分裂癥伴精神衰退；系統性紅斑狼瘡（有心、肺、腎、肝及神經系統並發癥之壹者）；再生障礙性貧血；心臟手術後抗凝治療。其余可報銷的特殊病種，以當地具體政策為準。
特殊病種的特定門診治療包括治療期間必須的支持療法和全身、局部反應對癥處理，壹般輔助治療不列入報銷範圍。