（壹）個人賬戶空賬缺口龐大。截至2011年4月，我國個人賬戶空賬高達1.5萬億元。隨著我國老齡化的加劇，2010年我國超過60歲的老年人口達1.74億，大約占總人口的12.8%，預計到“十二五”末將達到15%左右，並且在十幾年內將進入到老齡化的高峰，這對養老保險、醫療保險的影響尤為巨大，政府如不采取強力措施，個人賬戶空賬缺口將繼續擴大。如果不解決好個人賬戶空賬問題，勢必可能重新拖累目前已有的積累基金，使制度永遠無法實現既定的轉軌的目標。另外，個人賬戶做實工作從2001年遼寧試點以來，進展緩慢。
（二）個人賬戶基金收益率偏低，保值增值困難。中國統賬結合的城鎮職工養老保險模式，設計了養老保險分為統籌賬戶和個人賬戶的制度，由於基金當期支付壓力大，本應實賬的個人賬戶基金大部分都在空賬運行，其基金被用於支付當期的養老金，為解決該問題，2001年開始啟動做實個人賬戶試點，目前全國已有13個省市區開展試點，根據2010年度人力資源和社會保障事業發展統計公報，13個做實企業職工基本養老保險個人賬戶試點省份***積累基本養老保險個人賬戶基金2，039億元。面對如此巨額的個人賬戶資金，它的保值增值就顯得特別重要。但我國政府出於安全性考慮，對個人賬戶基金的投資範圍和投資工具進行了嚴格的限制。另外，由於宏觀經濟波動及通貨膨脹的影響，使得基金的投資效率低下，難以實現保值。我們從投資相對靈活的全國社保基金就可略見壹斑。而對於分散於各地的個人賬戶基金更是只能存於銀行或購買國債，其收益率低就可想而知。
這兩年基金不但沒有實現保值增值，反而大幅縮水。分散於各地的社保基金只能將其存入銀行或購買國債，收益率更是只有2%左右，如果再加上通脹率，基本是負利率，存在嚴重的貶值風險。這勢必影響到我國社會保障制度的可持續發展，影響和諧社會的建設。
此外，目前省際發展水平差距較大，沿海發達省份與中西部欠發達省份之間在基金的投資管理水平和贏利機會上存在很大差距，收益率難免出現較大差別。並且對部分省份來說，投資專業人才短缺，省級政府主導信托投資，容易出現問題。而壹旦出現問題，其最終結果還是由中央政府出面做最後擔保人，中央政府負責買單，這將很可能成為新壹輪社保違規的風險源。