2006年
第七屆“中國優秀財經證券網站”評選結果於2006年11月22日在深圳揭曉，招商證券牛網榮獲亞軍，這是牛網連續七屆獲得“最佳券商網站”殊榮，同時本屆招商證券牛網還獲得“最具人氣證券網站”獎。本次評選活動歷時三個多月，首次采用了通過全國投資者直接投票和專家評審組相結合的方式進行。
2006年12月10日的“2006年度深圳金融創新獎頒獎晚會”上，招商證券“基金寶”、“萬科股改”項目分獲二、三等獎，獲獎總數居參評券商之首。
招商證券“基金寶”是國內首只基金中的基金，以設計創新、風險適中、業績優秀等特點深獲投資者喜愛，管理規模居行業前列。“萬科股改”項目則是創造性推出百慕大式認沽權證方案，探索出了含B股和低送出能力上市公司的股改模式。“基金寶”和“萬科股改”項目得到市場和同業的充分肯定，曾獲深圳證券業協會年度金融創新獎等多個獎項。
招商證券是國內優質創新試點券商，曾先後推出過業內第壹個專業證券網站牛網、第壹個多媒體服務中心call-center、第壹張證券卡牛卡、第壹個大集中交易系統，第壹個券商FoF產品招商證券“基金寶”和第壹個含B股和低送出能力上市公司的股改模式。在服務、產品、信息系統等各個領域創新成果卓著。招商證券楊鶤總裁在發言時稱，2006年，招商證券剛度過了它15周年的生日。在接下來的日子裏，招商證券將積極籌備融資融券、股指期貨、備兌權證等創新業務，並且於年底推出了“基金寶二期”。
此次金融創新獲獎單位還包括深圳證券交易所、招商銀行等。
2007年
21世紀經濟報道主辦的“中國券商獎”評選活動中榮獲最具資產管理實力團隊、最佳研發團隊、最佳營銷服務團隊、最佳並購團隊、最具贏利能力經紀團隊五項大獎，在所有參選券商中獲獎最多。
2006年，招商證券經紀業務團隊以先進的服務手段、優良的服務質量、強大的營銷能力和豐碩的創新成果，取得了卓越成就，顯示了非凡的贏利能力。是年客戶規模達到110萬，托管資產為1087億元，總收入11.7億元，營業部部均收入實現2340萬元。
2006年，招商證券以其管理產品數量多、規模大、收益高、創新能力強、風險管理到位、服務體系完善等明顯優勢，表現出卓越的資產管理實力，享譽業內。招商證券建立的完善風險管理體系和客戶服務體系，使公司資產管理實力大大提升。公司管理著“基金寶”、“現金牛”、“華能專項計劃”等3只理財產品，並即將推出第4只理財產品，產品數列券商首位。其中，“基金寶”作為國內第壹只券商FoF（基金中的基金）產品，豐富了國內資本市場的投資品種。截止2006年底，招商證券管理的集合理財產品總規模達到69.8億，在國內券商中排名首位。招商證券“基金寶”單位累計凈值達到1.5178元,遠高於預期收益率。而設計上定位於收益風險適中的“現金牛”，其收益率也遠高於市場上其它同類產品,七日年化收益率最高達到6.415%。2006年理財產品給客戶帶來豐厚投資收益的同時，也為招商證券創造了2.52億元的資產管理業務收入，名列券商之首。
在3月22日-23日於北京舉行的2007年度中國企業信息化500強大會上，招商證券壹舉將五項大獎納入囊中，包括：“2007年度中國企業信息化500強”、“中國企業信息化標桿企業”、“優秀信息化團隊建設獎”、“傑出信息化領導者獎”、“中國企業信息化年度CIO大獎”，成為此次參獎券商中獲獎最多的壹家。
此次進入企業信息化500強，已經是招商證券第五次連續獲得該獎項。更加值得壹提的是，招商證券成為七家入選第三批企業信息化標桿的企業之壹。國家信息化測評中心負責人介紹，“標桿企業”是指信息化建設取得顯著成效，具有先進性（包括部分方面）、示範性和行業代表性的企業。
2007年4月21日，深圳證券交易所“資本市場發展與創新”論壇暨“第九屆會員單位與基金公司優秀研究成果評選頒獎”在深圳威尼斯酒店舉行。
本次評選，深交所在市場熱點、市場創新、市場主體、投資研究等四大類別設置了獎項。招商證券研發中心提交的《做多中國崛起，穿越理性繁榮》（趙建興，魯信文，盧賢義，景誌鐘，薛華，季偉***同撰寫）獲得投資研究類壹等獎，《尋找中國的“tenbagger”》（趙建興）研究貢獻獎。