國家建設高水平大學公派研究生項目選派類別為攻讀博士學位研究生和聯合培養博士研究生，其中，攻讀博士學位研究生的選派比例應占50%。鼓勵聯合培養博士生在雙方高校協議基礎上獲得聯合博士學位（joint degree）或者雙博士學位（double-degree）。
《國家建設高水平大學公派研究生項目》簽約高校名單：
西北農林科技大學、北京師範大學、哈爾濱工業大學、中國農業大學、山東大學、同濟大學、東南大學、吉林大學、中國礦業大學、中國地質大學(武漢)、西北工業大學、中國地質大學(北京)、四川大學、華東師範大學、中國海洋大學、國防科學技術大學、大連理工大學、北京郵電大學、武漢大學、天津大學、中南大學、重慶大學、電子科技大學、浙江大學、華中科技大學、西安交通大學、華南理工大學、東北大學、南開大學、中山大學、南京大學、北京航空航天大學、中央財經大學、北京科技大學、北京大學、中國科學技術大學、中國礦業大學(北京)、廈門大學、上海交通大學、湖南大學、中國石油大學(北京)、北京理工大學、蘭州大學、中國人民大學、復旦大學、上海財經大學、中央民族大學、清華大學、中國石油大學(華東)、河海大學、中國政法大學、四川農業大學、北京交通大學、華東理工大學、上海大學、武漢理工大學、西南大學、華中師範大學、南京農業大學、北京林業大學
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