壹、改革分配方式。要圍繞使“市場在資源配置中起決定性作用”深化財政專項資金分配改革，推行競爭性分配。
1、改過去“壹對壹”為“壹對多”分配。根據專項資金類別，推行不同的競爭性分配方式：分配對象為企業且市場化程度較高的，采取招投標方式，由市場競爭決定資金分配歸屬；
分配對象為政府部門或下級財政的，由部門和單位申報績效目標，推行專家評審、集體討論等競爭性決策方式；上級要求資金配套的，按有關規定分配；未有規定的推行競爭性分配。
2、改過去“事前獎補”為“事後獎補”。即更加註重對在建項目、建成項目的獎補，如：貸款貼息、專項事後獎補等，切實防止以事前項目套取、騙取財政專項資金。
二、規範分配管理。財政專項資金的競爭性分配，應堅持“兩不變”，即：堅持不改變主管部門對財政專項資金項目的管理職能和主體責任；不改變主管部門對財政專項資金項目的分配權、管理權。突出“五個強化”，即：強化主管部門對財政專項資金項目監督管理主體職能作用；
強化財政部門對財政專項資金的監督管理主體職能作用；強化紀檢監察等部門對財政專項資金項目申報、評審、實施等過程監管；強化財政專項資金審計監督；強化財政專項資金項目的社會監督。
擴展資料完善扶持企業發展專項資金管理的建議
1、建立健全專項資金審批制度。審計中發現專項資金的審批環節還存在很大漏洞，特別是扶持企業發展專項資金屬於新生事物，由於專項資金下撥要求的時間緊，在制度不健全的情況下就開展審批工作，壹來容易項目定位不準，二來容易滋生錢權交易。
因此建立健全專項資金審批制度是當務之急，制度的建立要遵循“公開透明、客觀公正”的原則，明確審批的每個環節，同時對每個環節的集體決策要留下痕跡。
2、將專項資金納入財政集中支付，建立嚴格的支付程序。對扶持企業發展專項資金，從項目申報立項、資金撥付與會計處理、資金到位、項目資金使用績效評價等各個環節，都要從源頭上予以規範，要確保程序完整，操作合法合規。
財政部門應該對專項資金建立嚴格的支付審批程序，資金使用單位應該加強內控管理，規範會計核算，對資金使用程序嚴格控制把關。
湖北審計廳-扶持企業發展專項資金分配使用中存在的問題及建議