農村合作醫療保險，是指由政府組織、引導、支持，農民自願參加，個人、集體和政府多方籌資，以大病統籌為主的農民醫療互助***濟制度。采取個人繳費、集體扶持和政府資助的方式籌集資金。農村合作醫療是由我國農民自己創造的互助***濟的醫療保障制度，在保障農民獲得基本衛生服務、緩解農民因病致貧和因病返貧方面發揮了重要的作用。
醫療保險壹般指基本醫療保險，是為了補償勞動者因疾病風險造成的經濟損失而建立的壹項社會保險制度。通過用人單位與個人繳費，建立醫療保險基金，參保人員患病就診發生醫療費用後，由醫療保險機構對其給予壹定的經濟補償。
基本醫療保險制度的建立和實施集聚了單位和社會成員的經濟力量，再加上政府的資助，可以使患病的社會成員從社會獲得必要的物資幫助，減輕醫療費用負擔，防止患病的社會成員“因病致貧”。
法律依據：
《國務院辦公廳轉發衛生部等部門關於建立新型農村合作醫療制度意見的通知》
四、資金管理
農村合作醫療基金是由農民自願繳納、集體扶持、政府資助的民辦公助社會性資金，要按照以收定支、收支平衡和公開、公平、公正的原則進行管理，必須專款專用，專戶儲存，不得擠占挪用。
(壹)農村合作‘醫療基金由農村合作醫療管理委員會及其經辦機構進行管理。農村合作醫療經辦機構應在管理委員會認定的國有商業銀行設立農村合作醫療基金專用賬戶，確保基金的安全和完整，並建立健全農村合作醫療基金管理的規章制度，按照規定合理籌集、及時審核支付農村合作醫療基金。
(二)農村合作醫療基金中農民個人繳費及鄉村集體經濟組織的扶持資金，原則上按年由農村合作醫療經辦機構在鄉(鎮)設立的派出機構(人員)或委托有關機構收繳，存入農村合作醫療基金專用賬戶；地方財政支持資金，由地方各級財政部門根據參加新型農村合作醫療的實際人數，劃撥到農村合作醫療基金專用賬戶；中央財政補助中西部地區新型農村合作醫療的專項資金，由財政部根據各地區參加新型農村合作醫療的實際人數和資金到位等情況核定，向省級財政劃撥。中央和地方各級財政要確保補助資金及時、全額撥付到農村合作醫療基金專用賬戶，並通過新型農村合作醫療試點逐步完善補助資金的劃撥辦法，盡可能簡化程序，易於操作。要結合財政國庫管理制度改革和完善情況，逐步實現財政直接支付。關於新型農村合作醫療資金具體補助辦法，由財政部商有關部門研究制定。
(三)農村合作醫療基金主要補助參加新型農村合作醫療農民的大額醫療費用或住院醫療費用。有條件的地方，可實行大額醫療費用補助與小額醫療費用補助結合的辦法，既提高抗風險能力又兼顧農民受益面。對參加新型農村合作醫療的農民，年內沒有動用農村合作醫療基金的，要安排進行壹次常規性體檢。各省、自治區、直轄市要制訂農村合作醫療報銷基本藥物目錄。各縣(市)要根據籌資總額，結合當地實際，科學合理地確定農村合作醫療基金的支付範圍、支付標準和額度，確定常規性體檢的具體檢查項目和方式，防止農村合作醫療基金超支或過多結余。
(四)加強對農村合作醫療基金的監管。農村合作醫療經辦機構要定期向農村合作醫療管理委員會匯報農村合作醫療基金的收支、使用情況；要采取張榜公布等措施，定期向社會公布農村合作醫療基金的具體收支、使用情況，保證參加合作醫療農民的參與、知情和監督的權利。縣級人民政府可根據本地實際，成立由相關政府部門和參加合作醫療的農民代表***同組成的農村合作醫療監督委員會，定期檢查、監督農村合作醫療基金使用和管理情況。農村合作醫療管理委員會要定期向監督委員會和同級人民代表大會匯報工作，主動接受監督。審計部門要定期對農村合作醫療基金收支和管理情況進行審計。