1、深圳醫保異地就醫報銷比例與市內並無區別，壹檔門診報銷：70%由個人賬戶支付，30%由統籌基金按規定支付；壹檔住院報銷：起付線以上部分按規定支付95%或90%。
2、辦理了轉診或者備案手續的，按照以上比例給予記賬。
3、未辦理轉診或者備案手續的，按照以上支付標準的90%記賬。
深圳醫保異地就醫報銷對象
深圳市異地安置退休、異地長期居住、常駐異地工作和異地轉診4類就醫人群住院費用可以直接異地報銷。
深圳醫保異地就醫報銷範圍
(壹)住院醫療費用報銷
參保狀態正常的我市基本醫療保險壹檔、二檔(少兒)、三檔參保人,異地就醫發生的住院基本醫療費用、地方補充醫療費用，包括自行就醫、轉診、常住內地登記等住院類型。
(二)門診醫療費用報銷
包括普通門診報銷、門診年度超支、門診特檢報銷、門診大病報銷等類型。
1、門診普通報銷：基本醫療保險壹檔參保人，個人賬戶有余額參保人。
2、門診年度超支：基本醫療保險壹檔參保人，就診前連續參保滿12個月，滿足辦理常住內地備案或市外轉診其中壹種情形。
3、門診特檢報銷：基本醫療保險壹檔參保人，滿足辦理常住內地備案或市外轉診其中壹種情形。
4、門診大病報銷：辦理深-圳市大病門診登記，滿足辦理常住內地備案或市外轉診其中壹種情形的基本醫療保險壹檔、二檔(少兒)、三檔參保人。
法律依據：
《中華人民***和國基本醫療衛生與健康促進法》第八十二條
基本醫療服務費用主要由基本醫療保險基金和個人支付。國家依法多渠道籌集基本醫療保險基金，逐步完善基本醫療保險可持續籌資和保障水平調整機制。公民有依法參加基本醫療保險的權利和義務。用人單位和職工按照國家規定繳納職工基本醫療保險費。城鄉居民按照規定繳納城鄉居民基本醫療保險費。
《社會保險法》第二十四條
國家建立和完善新型農村合作醫療制度。
新型農村合作醫療的管理辦法，由國務院規定。