BPT與MPT的分析框架式相似的，都是在壹定風險下尋求最大收益，在風險與收益平面內構造有效邊界，並根據效用函數判斷最優組合。但兩者也存在較大差異，這體現在風險度量與未來收益的確定方面，這種差異主要源於對投資者心理與行為理解的不同。MPT中的投資者對未來各種不同前景出現的概率以及相應的期望值能夠進行客觀公正的估價，而且因為投資者均是理性人，他們的估值也沒有差異。其直接結果便是產生壹條供所有投資者選擇的有效邊界。但在BPT中的投資者是自然人，他對未來的估計會受到恐懼、希望等感情因素的影響，而且不同的投資者其影響的程度有所不同。這種差異體現在對未來收益的期望均值估值不同，悲觀者會使之偏低而樂觀者會使之偏高，與此對應的是每壹個投資者都有屬於自己的有效邊界。
MPT以預期效用理論為基礎，投資者均是風險厭惡者，對待風險的態度始終不變，其差別是厭惡程度不同，以效用函數u-δ2/d中的d表達風險容忍程度。而BPT以期望理論為基礎，投資者是損失厭惡者，他們壹方面尋求安全保證，另壹方面又追求高風險以期望高收益。其投資者對風險的態度是多重度量的，用qs、qp、A、δ、γ五個參數來描述。由於假定投資者對待風險態度的不同，因而兩個理論對風險的度量也有所不同。MPT以δ度量風險，BPT以Pr|W<A|度量風險。
根據行為組合理論的原理，投資者在進行投資時會按照在上升潛力層或下降保護層中選擇合適的證券品種。由於認知能力有限，投資者往往用固定模式來簡化信息處理，即在選擇階段按照“貼標簽”(labeling)的方法將特定的投資品種予以歸類。證券投資基金在募集發起時，已經考慮到了不同的投資主體對資金的需求狀況以及各自的投資偏好。為了實現基金的募集成功，基金在發行時會根據特定的募集對象確定投資策略和投資風格，即確定自己的標簽。