醫學院設有臨床醫學、麻醉學、口腔醫學、醫學檢驗、臨床醫學(定向)5個本科專業，臨床醫學、口腔醫學、藥學、醫學檢驗、醫學影像技術、衛生信息管理、中西醫結合7個專業。管理機構包括辦公室、教研管理科、學生科、團委和培訓辦公室。業務機構包括基礎醫學系、臨床醫學系和醫學技術與管理系，設有15教研室。醫學院建立了省內壹流的現代醫學科學研究中心(與新醫學科學研究所合署辦公)，設有醫學教育研究室(與中巴項目辦合署辦公)和法醫鑒定中心等研究機構。醫學實驗中心設有基礎醫學、藥學、臨床技能綜合實驗室，有近百家教學實習醫院。陸豐校區有醫學圖書館和附屬醫院，方便教學、科研和醫療。校內其他教學設施如網絡管理、電教、多媒體技術、語音實驗室等由學院統壹管理，實現資源共享。
教學模式:
醫學院積極開展教育教學改革，先後實施了“兩強化壹優化”(SSO模式)、“全科醫學”和“兩階段臨床醫學教育”改革項目，在國內率先引進和使用標準化病人(SP)技術，建立臨床技能實驗室，獲得國家級教學改革成果獎2項，省級教學改革成果獎6項。在對外交流與合作方面，10年來，先後派出100多人次赴美國、菲律賓、印度尼西亞、澳大利亞、泰國、西班牙、德國、南非等國家和臺灣省、香港、澳門等地區參加國際學術會議和學習訪問，與美國凱特林醫學中心、泰國清邁大學醫學院、蒙古多諾比醫學院等國際社會建立了友好合作關系。